La conservazione delle opere è affidata a un deposito, visitabile su richiesta, costituito da blocchi di rastrelliere compattate ma estraibili per la visione ravvicinata dei singoli dipinti.

Il deposito è ubicato al secondo piano e ha una superficie utile di circa 150 metri quadrati. È di facile accesso e in continuità spaziale con gli uffici dei curatori e le scale di servizio. Il suo dimensionamento permette di poter raggruppare in un unico spazio tutto il materiale iconografico e fotografico con notevoli vantaggi sia per la conservazione sia per la consultazione generica e specializzata.

La capacità ricettiva del deposito prevede un accrescimento del 50% dei numeri attuali di catalogo.